+Page de titre
+Manuscrits du fonds Matthieu Bonafous : inventaire thématique.
+Etudes sur le mûrier, la soie et les vers à soie
+Etudes sur le riz et le maïs.
+Questions de botanique et d'agriculture
+Questions de zoologie
+Questions de médecine, de physique et de biochimie
+Correspondance
+Lettres autographes diverses classées par ordre chronologique, 1824-1851.
+Lettres autographes diverses classées par ordre chronologique, 1828-1865.
+Correspondance agricole adressée à Matthieu Bonafous et classée par ordre chronologique, 1837-1838.
+Lettres de Jean-Baptiste Balbis, directeur du Jardin des plantes à Lyon, à Matthieu Bonafous, 1822-1831..
+Recueil de notes, lettres, traités et mémoires divers.
+Littérature et manuscrits latins
+Récits de voyage
+Divers